根据《财政部 国家税务总局关于进一步支持企业事业单位改制重组有关契税政策的通知》(财税〔2015〕37号)第六条第二款规定，同一投资主体内部所属企业之间土地、房屋权属的划转，包括母公司与其全资子公司之间，同一公司所属全资子公司之间，同一自然人与其设立的个人独资企业、一人有限公司之间土地、房屋权属的划转，免征契税。
因此，母公司将房产划转给全资子公司，免征契税。
按最新文件财税(2012)4号文件第八条的规定:同一投资主体内部所属企业之间土地、房屋权属的划转，包括母公司与其全资子公司之间，同一公司所属全资子公司之间的土地、房屋权属的划转，免征契税。
单从字面上理解,凡是母、子公司之间的房屋划转,是应免契税的,但很多税务机关或纳税人又提出疑问，母公司将房地产投资于全资子公司是否属于4号文中的“划转”免契税呢?我们再从以下几方面进行解析。
《国家税务总局关于全资子公司承受母公司资产有关契税政策的通知》国税函[2008]514号规定：公司制企业在重组过程中，以名下土地、房屋权属对其全资子公司进行增资，属同一投资主体内部资产划转，对全资子公司承受母公司土地、房屋权属的行为，不征收契税，虽然该文截止目前也全部废止，但该文件对“母公司用房产对全资子公司增资，属同一投资主体内部资产划转”的文件精神，应该是继续适用的。
《财政部、国家税务总局关于深圳万科企业股份有限公司内部土地权属转移不征契税的批复》财税[2004]143号，曾对万科投资的土地作过如下批复：“你市万科新城房地产有限公司是由万科企业股份有限公司两家全资公司万科房地产有限公司和新万实业有限公司出资成立的。
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