抵扣税额-开票税额，如果抵扣大于开票，则需要交货款的1%为增值税。如果抵扣小于开票，这一部分差额是必须要交的，然后再交货款的1%增值。来税法规定的扣税凭证有：增值税专用发票，海关完税凭证，免税农产品的收自购发票或销售发票，货物运输业统一发票。
另外，增值税纳税人购买增值税税控系统专用设备支付百的费用以及缴纳的技术维护费(以下称二项费用)可在增值税应纳税额中全额抵减。因此，取得购入增值税税控系统增值税专用发票以及税控软件维护费的地税发票也可以抵扣。
一般纳度税人取得海关完税凭证，应当在开具之日起问90日内后的第一个纳税申报期结束以前向主管税务机关申报抵扣，逾期不得抵扣进项税额;
一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的海关收款书，应在开具之日起180日内向主管税务机关报送《海关完税凭证抵扣清单》申请稽核比对，实行“先比对后抵扣”。纳税人取得2009年12月31日以前开具的增值税扣税凭证，仍按原规定答执行。小规模纳税人不允许抵扣。
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