如果已经开具的发票并且对方认证后，不慎将该发票丢失，可以按照以下步骤进行处理：
立即向开票方报告此事，并请求其重新开具相同内容的发票。同时，提供一份正式的发票丢失声明，这通常需要在税务部门进行备案。
在重新收到发票后，需要将之前丢失的发票的所有联次(包括存根联、发票联和抵扣联)进行认证，并在认证通过后才能继续使用。
如果在取得新发票前已经将旧发票的所有联次丢失，则需要将相关情况进行详细说明并提供丢失声明等相关证明材料。需要到主管税务机关进行登记并接受处罚。处罚的多少取决于是否认证该份发票。具体以主管税务机关的判定为准。点击领取：税收筹划十大方法
以上情况适用于一般纳税人企业。如果是小规模纳税人企业，需要按照相关规定进行操作。同时，还需要注意，在补开或者换开发票、其他外部凭证过程中，要符合税收征管法等有关发票管理规定。
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